簡介：在太一一行人告別數碼世界後，數碼世界並沒有就此關閉朝向人類的大門
，而數碼世界的內部卻沒有太平多少時日
，就又開始了紛爭。　　數碼世界急需一批被選中的孩子來維護數碼世界和人類世界的和平。太一、阿和

、素(su)娜(na)等(deng)人(ren)都(dou)已(yi)先(xian)後(hou)成(cheng)為(wei)了(le)初(chu)中(zhong)生(sheng)，沒(mei)有(you)太(tai)多(duo)精(jing)力(li)和(he)時(shi)間(jian)能(neng)夠(gou)和(he)數(shu)碼(ma)寶(bao)貝(bei)們(men)一(yi)起(qi)並(bing)肩(jian)作(zuo)戰(zhan)，隻(zhi)有(you)阿(e)武(wu)和(he)小(xiao)光(guang)成(cheng)為(wei)了(le)新(xin)一(yi)代(dai)的(de)領(ling)頭(tou)人(ren)。被(bei)選(xuan)中(zhong)的(de)孩(hai)子(zi)有(you)本(ben)宮(gong)大(da)輔(fu)（木內玲子 配音）、井之上京（夏樹莉緒 配音）、火田伊織（夏樹惠 配音）等人，和他們一同戰鬥的除了亞古獸、加布獸等，還有新的數碼寶貝參與。於是，在第一代數碼人的帶領下，新的數碼寶貝和守護者們開始了同邪惡勢力的作戰………